Descriptif du poste
Stage conventionné de six mois, de Mars 2024 à Août 2024, pour un.e étudiant.e en Master2 au CIRAD-Lavalette (Agropolis), Montpellier.
Stage de 6 mois, de Mars 2024 à Août 2024 pour un.e étudiant.e en Master2 au CIRAD-Lavalette (Agropolis), Montpellier.
Sujet : Une variété de riz pluvial avec moins d’aérenchymes dans les racines a-t-elle aussi moins d’aérenchymes dans les feuilles ?
Un premier travail de mise au point des méthodes sera fait avec une étudiante sur deux variétés d’Octobre 2023 à Février 2024.
Ce deuxième stage aura pour objectif d’utiliser ces méthodes pour établir la corrélation entre les volumes relatifs d’aérenchymes aérien et racinaire sur 1) un panel de 10 variétés de riz contrastées pour leur adaptation aux différents types de culture depuis la rizière inondée jusqu’au riz pluvial et 2) un panel de lignées CRISPR-éditées pour éteindre des gènes de régulation de la formation des aérenchymes.
Les plantes seront cultivées dans des pots dans des chambres de culture contrôlée. Trois niveaux d’alimentation hydrique seront croisés afin de déterminer les possibles interactions. En fonction des résultats du stage précédent, les feuilles de rang 5 ou 7 seront prélevées à la fin de leur élongation et coupées transversalement à la distance de son point d’attache trouvée la plus pertinente. Des images de ces coupes seront réalisées avec un microscope à épifluorescence et avec un scanner très haute définition et le volume relatif d’aérenchymes sera estimé à l’aide d’un pipeline semi-automatique d’analyse d’image basé sur ImageJ.
Des prélèvements de racines seront effectués simultanément avec les prélèvements de feuilles. Des coupes transversales seront effectués à 1 cm de la base de la racine, photographiés sous microscope à épifluorescence et analysées à l’aide du pipeline semi-automatique d’analyse mis au point en 2022.