TECHNICIEN DE RECHERCHE EN AQUACULTURE F/H

Descriptif du poste

Vos missions

Sous l’autorité du Chef de l’Unité Virologie, immunologie et écotoxicologie des poissons (VIMEP), vous participerez à l’optimisation des processus d’évaluation du bien-être de poissons, au développement d’outils de monitoring et à la mise en place d’un nouveau poisson modèle. Ces travaux seront menés dans le cadre de différents projets, en relation avec différentes unités Anses (Epidémiologie, Santé et Bien-Etre à Ploufragan et Epidémiologie et Appui à la Surveillance à Lyon) et d’autres partenaires.        

 Votre équipe

L’unité VIMEP est Laboratoire national de référence (LNR) pour les maladies réglementées des poissons et assure à ce titre un certain nombre de missions d’appui scientifique et technique, notamment des activités analytiques en virologie, sérologie et biologie moléculaire. Elle développe en parallèle des activités de recherche sur les agents infectieux, l’impact de polluants anthropiques sur la santé des poissons - en intégrant le développement d’outils d’analytiques et d’approches transversales (utilisation de challenges infectieux pour évaluer l’impact de polluants sur l’immunité par exemple), la mise au point de stratégies de contrôle et de prévention des maladies, ou encore les effets du changement climatique, … ; 

Votre quotidien

Améliorer l’évaluation des effets de stress environnementaux sur la truite arc en ciel

• Participer à la définition de grilles de scoring et à l’identification de marqueurs pertinents de l’état de bien-être / de santé ;
• Participer à la mise en place de méthodes simples de suivi de certains indicateurs ;
• Réaliser le suivi des animaux soumis à des stress (multi-exposition chimique/virus/toxine ; hyperthermie, …) ;
• Synthétiser et analyser les résultats des mesures ;
• Contribuer à la formation du personnel aux outils développés/optimisés.

Participer au développement d’un monitoring vidéo adapté à la détection des signes d’infection virale chez le bar Européen

• Identifier le matériel nécessaire / concevoir le système le plus adapté à l’acquisition d’images ;
• Participer à la définition du protocole de prise d’images ;
• Gérer les prises d’images avant et après infection en intégrant en complément un suivi visuel (grille de scoring) ;
• Annoter les images pour réaliser du Machine Learning et permettre l’automatisation du système de monitoring.

Contribuer à la mise en place d’un nouveau modèle, le médaka japonais

• Participer à la reproduction des animaux et aux essais de mise au point de challenges infectieux (viraux / bactériens).

Assurer la traçabilité du travail effectué (cahier de laboratoire) et contribuer à la mise à jour de la documentation qualité (procédures / modes opératoires / grilles de scoring …), la complétude des registres d’utilisation des animaux et des analyses rétrospectives ;

Interagir avec les partenaires intra-Anses et externes et participer à la présentation et valorisation des résultats obtenus.