DÉPÉRISSEMENT DU FRAISIER : CARACTÉRISATION DES AGENTS PATHOGÈNES, PATHOGÉNICITÉ ET RISQUE DE RECONTAMINATION PAR LES SUBSTRATS F/H

Descriptif du poste

Entreprise :
CTIFL
Ce stage s’inscrit dans un projet visant à identifier les agents pathogènes du dépérissement de fraisiers, à déterminer les conditions favorisant leur développement, à évaluer la sensibilité variétale et à proposer différentes méthodes de protection adaptées.

Missions :
La France assure environ 5 % de la production européenne de fraises, à partir de plants d’origines variétales diverses et de sensibilité variable aux conditions climatiques. Depuis 2024, des symptômes précoces de dépérissement ont été observés sur fraisier : croissance ralentie, taches foliaires brun-beige à bordure foncée, évoluant vers le dépérissement du plant. En 2025, ces dépérissements se sont intensifiés, notamment dans le Sud-Est, avec des pertes atteignant jusqu’à 50 %. Des observations préliminaires ont mis en évidence la présence de champignons des genres Neopestalotiopsis et Pestalotiopsis (Pesta-like). Leur isolement et leur production in vitro restent un verrou technique, pourtant indispensable pour mener des essais de pathogénicité et tester des solutions de protection. De plus, l’une des pratiques courantes chez les producteurs est la réutilisation des substrats hors-sol, laissant subsister des débris végétaux potentiellement porteurs de Pesta-like, posant des questions sur un risque de recontamination. Ainsi, l’objectif du stage est d’isoler les agents responsables de ces dépérissements, de les produire in vitro, de caractériser leur pathogénicité et leur présence dans les substrats. Un dernier volet pourra être abordé lors de l’évaluation de produits de protection in vitro, en fonction de l’avancée du stage.

Plusieurs phases auront lieu durant ce stage :

• Recherche bibliographique sur les méthodes d’identification des pathogènes, la production d’inoculum in vitro et les biosolutions d’intérêt.
• Caractérisation de la sensibilité/résistance des fraisiers aux pathogènes identifiés par des essais de pathogénicité : rédaction du protocole d’inoculation, réalisation des pathotests, notation des symptômes et analyse des données.
• Évaluation des risques liés à la réutilisation de substrats.
• Criblage in vitro de produits de biocontrôle et de substances actives chimiques.