DIVERSITÉ GÉNÉTIQUE ET PHÉNOTYPIQUE DE LEVURES DE CONTAMINATION ISOLÉES DE VINS F/H

Descriptif du poste

Associés dans un laboratoire commun (LabCom Oenoledge), l’UMR OEnologie et la société BioLaffort proposent le stage suivant : Diversité génétique et phénotypique de levures de contamination isolées de vins.

Contexte :
Depuis plusieurs années, la mise en cause de levures comme agents de contamination des vins a été démontrée, notamment dans un contexte de réduction des produits de stabilisation microbiologique, comme le dioxyde de soufre, et d’augmentation du pH. Si les travaux ont principalement porté sur l’espèce Brettanomyces bruxellensis, d’autres espèces décrites dans les vins en élevage ou après mise en bouteille ont été peu étudiées. Des travaux antérieurs ont rapporté des propriétés de certaines autres levures non-Saccharomyces, dont celles du genre Pichia, en lien avec la contamination des vins, telles que la capacité à produire des phénols volatiles, la cadavérine, ou à former des biofilms. Les travaux portent en général sur un nombre limité d’isolats et la variabilité intra-espèce des capacités à contaminer le vin a été peu étudiée.

Objectif :
Après avoir constitué une collection d’isolats du genre Pichia, l’objectif du travail est de :

• Caractériser la variabilité des propriétés de croissance et de production des composés volatils à l’origine de l’altération des vins, notamment les phénols volatiles, des différents isolats.
• Développer un outil moléculaire basé sur l’analyse multilocus de marqueurs microsatellites pour caractériser la diversité génétique intra-espèce et établir la structure des populations.
• Développer un outil moléculaire de quantification de l’espèce dans le vin, si le temps imparti le permet.

Méthodologies :
Méthodes classiques de microbiologie, développement de PCR multiplex pour le typage génétique à l’aide des marqueurs microsatellites et analyse bioinformatique, mise au point de protocoles de croissance et adaptation au vin, analyses chimiques des composés volatiles, traitement statistique des données collectées.