DOCTORANT F/H

Descriptif du poste

L’Institut de l’Elevage recrute Un Doctorant F/H – CDD 36 mois

Service Méthodes d'Evaluation Génétique et Applications

Contexte :

L'Institut de l'Elevage (Idele) est l'institut technique en charge des ruminants. Il couvre tous les domaines techniques et économiques de l'élevage et des filières des ruminants.

Son département Génétique et Gestion des Populations participe à de nombreux projets de R&D visant à améliorer le potentiel génétique des ruminants sur des critères d’intérêt dans un contexte agroécologique. Les travaux sont réalisés en interface avec de nombreuses disciplines : santé, conduite des troupeaux, économie….

En bovins, ces projets sont conduits au sein de l’équipe de l’Unité Mixte de Technologie (UMT) eBIS, qui associe INRAE, Idele et Eliance dans ce domaine d’activités.

Le poste :

Thèse sur l'amélioration des évaluations génétiques en bovins laitiers par l’intégration des interactions génétique x environnement, pour une sélection adaptée à la diversité des systèmes d’élevage et aux changements climatiques.

La génétique animale repose encore sur une vision uniforme des milieux d’élevage. En réalité, les troupeaux évoluent dans des contextes très contrastés en termes de climat, d’organisation du travail ou de conditions d'élevage. Cette diversité a un impact direct sur l’expression des caractères de production, de santé ou de fertilité.

Face à ces constats, il devient nécessaire de repenser les outils d’évaluation génétique en y intégrant des informations fines sur l’environnement. Cela suppose de caractériser cette diversité à l’échelle nationale, puis de développer des modèles capables de tenir compte des interactions entre génotype et environnement (GxE).

La thèse s’inscrit dans le cadre du projet CEVADE, coordonné par IDELE et INRAE, qui vise à caractériser les environnements d’élevage pour adapter les outils de sélection et de conseil.

• Elle vise à développer et tester des modèles d’évaluation génomique tenant compte des interactions GxE, en utilisant des descripteurs synthétiques des milieux d’élevage. Les objectifs sont les suivants :
• Estimer les paramètres génétiques de différents caractères (production, santé, fertilité) en fonction de typologies d’élevages ;
• Mise en place et test de modèles à normes de réaction dans un cadre d’évaluations génomiques single-step ;
• Étudier l’impact de ces modèles sur le classement des animaux et sur les réponses à la sélection dans différents contextes d’élevage ;
• Intégrer un indicateur climatique (l’indice température-humidité ou THI) pour modéliser les effets combinés de la conduite et de l'augmentation attendue de la température sur les performances.