STAGIAIRE M2 OU INGÉNIEUR EN DATA SCIENCE APPLIQUÉE À L'AGRICULTURE F/H

Descriptif du poste

Terres Inovia, l’institut de recherche et d’innovation pour la production et la transformation des oléagineux, des légumineuses à graines et du chanvre, a engagé des travaux en 2025 pour résoudre ce problème.

Contexte et Objectif :
Connaître les effets des cultures précédentes sur le rendement des cultures suivantes est important pour éclairer les choix d’assolement. La production de références se heurte toutefois aux coûts expérimentaux ou à l’inadéquation des données d’enquête en raison de l’absence de témoins « toutes choses égales par ailleurs ».
Grâce à Sentinel 2 et au Registre Parcellaire Graphique, des indices de végétation par différence normalisée (NDVI) ont été extraits sur des parcelles de blés « fusionnées », c’est-à-dire ayant porté plusieurs cultures l’année précédente. Des travaux préliminaires menés dans le Bassin parisien ont ainsi montré qu’un précédent pois améliore le NDVI moyen du blé de 10 à 15 % par rapport à un précédent blé. Un package R et une chaîne de traitement générique ont été développés par la suite pour étendre la démarche n’importe où en France, à toutes les campagnes depuis 2016 et à n’importe quel couple précédent-suivant.

Il s’agit dorénavant de produire des indicateurs plus pertinents que les indices de végétation, l’idéal étant d’aboutir au rendement. La prédiction du rendement à partir de séries temporelles d’indices de végétation (NDVI ou autre) et d’autres co-variables comme la météo et certaines caractéristiques des sols a fait l’objet de nombreux travaux. Qu’il s’agisse de réentraîner des modèles, de les améliorer ou simplement de s’en inspirer, les performances finales dépendront des données d’entraînement (qualité, résolution, profondeur temporelle et étendue spatiale). Le GIS Grandes Cultures offre un cadre approprié pour traiter cette question en raison des données de traçabilité parcellaire, en particulier les rendements et certaines données sur les sols, collectées par les coopératives partenaires depuis plusieurs années.

Missions :
Offre de stage : Modélisation du rendement des cultures à partir de données satellitaires et application à l’estimation des effets précédents

• Mener la revue des travaux sur le sujet pour identifier les variables d’intérêt et les ressources utilisables.
• Pré-traiter les données fournies par les coopératives et construire les tableaux (l’extraction des données satellitaires, météo et sol sera assurée grâce à d’autres outils internes).
• Selon les données effectivement disponibles chez les partenaires : évaluer la qualité des données sur les sols, notamment la réserve utile, disponibles dans les bases nationales en accès libre.
• Réaliser l’entraînement et l’évaluation des modèles de prédiction de rendement.
• Documenter et mettre le code à disposition.
• Appliquer à l’estimation des effets précédents des légumineuses à graines et rédiger un rapport.

Rattachement hiérarchique / Organisation :
Un comité de pilotage composé de personnels de Terres Inovia, des 3 coopératives partenaires, de l’INRAE et d’un représentant du GIS suivra la réalisation des travaux.
L’encadrement du stagiaire sera assuré par Christophe Sausse, ingénieur de réalisation à Terres Inovia.